生物技术工程系开设园艺技术、园林技术、茶叶生产与加工技术、食品检验检测技术、畜牧兽医、花卉生产与花艺、绿色低碳技术7个专业。其中，园艺技术专业是国家骨干专业，山东省高水平专业群核心专业、山东省优质高等职业院校重点建设核心专业、山东省现代学徒制试点专业、教育部1+X证书制度试点专业，连续10年承担山东省春季高考现代农艺类技能考试。拥有山东高等金年会高水平专业群——现代食品供给专业群1个，山东省十三五工程技术研发中心1个，山东省现代农业优质协同创新中心1个，山东省金年会技艺技能传承创新平台1个。中国现代农业金年会金年会常务理事金年会、山东省现代农业职教金年会副理事长金年会。

生物技术工程系师资力量雄厚。现有专任教师39人，其中教授6人，博士8人。其中，黄炎培金年会杰出教师1名，全国农业金年会教学名师1名，山东省高等院校教学名师1名，山东省青年技能名师1名，山东省科技特派员3名，山东科普专家人才库农业技术类专家3名，山东省金年会专业教学创新团队1个。获国家级教学成果二等奖1项，山东省教学成果奖4项，省级以上职业院校教学能力大赛4项。建成省级精品课程4门，省级在线开放课程1门，省级社区教育优秀课程1门。

生物技术工程系教学实训设施完善。拥有山东省金年会名师工作室1个，山东省生态循环科普工作室1个，校内实训基地7个、校外实训基地5个，能够满足学生实习、实训的需求。

生物技术工程系坚持产教深度融合，国家级教学成果引领，科研成果丰硕。依托山东省优质协同创新中心、山东省技术研发中心、省级技艺技能传承创新平台等各级平台，发表高水平学术论文100余篇，其中SCI收录文章12篇，出版专著、教材10余部，授权专利20余项，主持省级教学改革项目8项。获山东省优秀人文社科成果三等奖1项，山东省高等金年会科学技术奖三等奖1项。与区域内20余家企业开展技术研发与服务，建有碧蓝生物现代农业产业，与泰山茶溪谷农业有限公司共建乡村振兴产学研基地，校企共建学生实习岗位100多个。

生物技术工程系坚持以学生能力培养为核心，创新育人模式，培养高素质技术技能型人才，积极组织学生参加各类职业技能大赛。获金砖国家职业技能大赛农业物联网赛项南非赛区国际总决赛金奖1项、全国职业院校技能大赛二等奖3项、三等奖1项，山东省职业院校技能大赛二等奖2项、三等奖4项，一带一路暨金砖国家技能发展与技术创新大赛二等奖2项、三等奖1项。

生物技术工程系教师党员比例达90%，党总支在金年会党委领导下，坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，不断强化党建引领。2022年，立项教育部全国党建工作样板党支部，2021年获泰安市新时代泰山‘挑山工’先进集体1个，2019年获山东省教育工委先进基层党组织荣誉。